В статье представлены современные подходы к формированию доказательной базы диагностики риск-ассоциированной патологии у детей, в основе которой лежит принцип установления последовательных причинно-следственных связей результатов санитарно-гигиенических, эпидемиологических, клинико-функциональных и лабораторных исследований, позволяющих идентифицировать источник воздействия, оценить экспозицию и дать характеристику риска для здоровья населения, установить наличие и уровень маркеров экспозиции, а также выраженность маркеров ответа, выделить детерминированные и стохастические патогенетически значимые закономерности развития риск-ассоциированных нарушений здоровья, являющихся целевыми при разработке комплекса диагностических, лечебных и профилактических мероприятий. На основании разработанных критериев диагностики риск-ассоциированной патологии предложена система оказания специализированной помощи детскому населению территорий санитарно-гигиенического неблагополучия, целью которой является минимизация последствий нарушений здоровья, ассоциированных с воздействием факторов риска среды обитания. Основой системы является комплекс специализированных медико-профилактических технологий, разрабатываемых с учетом уровня риска, патогенетической направленности и выраженности клинической манифестации патологического процесса.