Полногеномное секвенирование штамма Staphylococcus aureus с атипичными свойствами, выделенного от ребенка, проживающего на территории, загрязненной выбросами металлургического завода

Актуальность проблемы: бактерии, в том числе Staphylococcus aureus, под влиянием загрязняющих веществ внешней среды могут изменять фенотипические свойства. Вероятно, основой таких изменений является приобретение штаммами новых генетических фрагментов. Цель работы: проведение полногеномного секвенирования штамма S. aureus для изучения возможных генетических изменений, связанных с антропогенным воздействием ксенобиотиков. Материалы и методы: объектом исследования служил штамм S. aureus Alex 451, выделенный от резидентного бактерионосителя, проживающего на территории, загрязненной выбросами металлургического комбината. Штамм проявлял резистентность к ряду ксенобиотиков: соединениям никеля, хрома, кадмия, марганца и пятиокиси ванадия. Полногеномное секвенирование проводили на секвенаторе GS Junior (Roche, Швейцария). Результаты и обсуждение: показано, что геном Staphylococcus aureus Alex 451 отличается от типичных представителей бактерий этого вида наличием фрагментов ДНК, кодирующих резистентность к некоторым металлам, и гена колицина V. В геноме выявлены последовательности, обуславливающие резистентность к ряду антибиотиков, которые, очевидно, можно рассматривать в качестве генетического резерва, имеющего потенциал последующего фенотипического проявления. Выводы: полногеномное секвенирование позволило выявить изменение генетической информации, которое мы связываем с длительным воздействием техногенных факторов.